Kaks mikroskoopide kasutust:
Bioloogiline mikroskoop: Üldiselt võib mikroskoobid jagada kahte kategooriasse: stereomikroskoobid ja bioloogilised mikroskoobid. Erinevate eesmärkide ja nõuete tõttu on tekkinud paljud harud, kuid põhiprintsiibid jäävad samaks. Polarisatsioon, faasikontrastsus, ülekanne ja langusvalgus klassifitseeritakse endiselt bioloogilisteks mikroskoopideks.
Stereoskoopiline mikroskoop: tuntud ka kui mikroskoop, tahke mikroskoop ja stereomikroskoop, see on mitme otstarbega mikroskoop. Seda on lihtne kasutada, see ei vaja proovide jaoks kõrgeid standardeid, sellel on pikk töökaugus ja sellel on vaatluse ajal tugev kolmemõõtmelisuse tunne. See suudab jälgida füüsilisi objekte ja teha mõned toimingud proovidel. Erinevalt bioloogilistest mikroskoopidest, mis nõuavad proovide viilutamist, nõuab viilutamine vastavaid tehnikaid ja seadmeid. Seetõttu on stereomikroskoopidel lai valik mikroelektroonikas, täppisinstrumentide kokkupanemisel ja hooldusel, mikro nikerdamisel ja muudel väljadel. Bioloogia ja meditsiini valdkonnas laialdaselt kasutatav anatoomiliste toimingute ja mikrokirurgia jaoks (praegu kirurgiliste mikroskoopidena klassifitseeritud) saab selle valgusallikaks kasutada ainult külma valgusallikaid (optilisi kiudu) bioloogia ja meditsiini valdkonnas; Kasutatakse tööstuses väikeste komponentide ja integreeritud vooluringide vaatluseks, kokkupanekuks, kontrollimiseks ja muuks tööks.
Metallograafiline mikroskoop: paljudele meeldib seda kirjutada kui "kuldse mikroskoobi". Metallograafiline mikroskoop on mikroskoop, mida kasutatakse spetsiaalselt läbipaistmatute objektide nagu metallide ja mineraalide metallograafilise struktuuri jälgimiseks. Neid läbipaistmatuid objekte ei saa jälgida tavalises ülekandemikroskoobis, seega on peamine erinevus nende vahel see, et esimene kasutab peegeldunud valgust, samal ajal kui teine kasutab valgustamiseks edastatud valgust. Metallograafilises mikroskoobis suunatakse valgustuskiire objektiiv läätselt vaadeldava objekti pinna poole, mida peegeldab objekti pind, ja seejärel naaseb objektiivi objektiivi kuvamiseks. Seda peegeldavat valgustusmeetodit kasutatakse laialdaselt ka integreeritud vooluringi räni vahvlite tuvastamisel.
