Digitaalsetel mikroskoopidel on peamiselt järgmised eelised:
1. Sellel on mikroskoopilise kaamera funktsioon, mis salvestab vaadeldud mikroskoopilisi efekte ja moodustab graafilisi faile, mida saab edastada vastavatele osakondadele; optilist mikroskoopi saab jälgida ainult läbi okulaari ja seda ei saa kasutada mikroskoopiliseks pildistamiseks.
2. Ühendatud erinevate kuvaseadmetega, nagu arvuti/tahvelarvuti/mobiiltelefon/televiisor/ekraan, saab korraga jälgida mitu inimest; optilist mikroskoopi saab jälgida ainult üks inimene.
3. Ekraani eelvaate abil saab vähendada silmade väsimust; optilisi mikroskoope tuleb kogu aeg läbi okulaari jälgida, mis põhjustab kergesti liigset silmade väsimust.
4. Digitaalse mikroskoobi kujutisseadmel võib olla mõõtmise, graafiliste aruannete printimise, videosalvestuse jms funktsioone; optilise mikroskoobiga saab teostada ainult mikroskoopilist vaatlust.
5. Digitaalne mikroskoop on uus ajastu kaasaegsete teadusinstrumentide arengus ja sellel on palju funktsioone, mida optilistel mikroskoopidel ei ole.
Digitaalsed mikroskoobid sobivad paljude tavaliste optiliste mikroskoopidega. Tavalisi optilisi mikroskoope saab muuta digitaalmikroskoobideks, paigaldades digikaamera (st elektroonilise okulaari). Seda on lihtne kasutada, intuitiivne ja kõrge kontrollitõhusus. See sobib elektrooniliste tööstuslike tootmisliinide kontrollimiseks, trükkplaatide kontrollimiseks, trükklülituste komponentide jootevigade (trükivale, longus jne) kontrollimiseks, ühe-plaadiarvuti kontrollimiseks, vaakum Fluorestsentsekraani VFD verifitseerimine jne, see suurendab tegelikku pilti ja kuvab selle arvutiekraanil ning saab pilti salvestada, suurendada ja printida. Seda saab mõõta mõõtetarkvaraga.
